Investigación

Bioinformática Traslacional

Unidad de Transferencia Tecnológica

Introducción

La Unidad de Transferencia Tecnológica de Bioinformática Traslacional del CIMETSA fue creada en el año 2019 y está dirigida por el Dr. Danilo Ceschin, Investigador Adjunto de la Carrera del Investigador Científico y Tecnológico (CONICET).

Esta unidad tiene como objetivo principal brindar soporte bioinformático a los proyectos de investigación del CIMETSA y de otros centros que lo requieran. La bioinformática es una disciplina indispensable en la investigación biomédica actual, que permite analizar e interpretar los grandes volúmenes de datos generados por las técnicas ómicas (genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica, etc.).

Entre las principales actividades que desarrolla la unidad se incluyen: análisis de secuenciación masiva, ensamblaje y anotación de genomas y transcriptomas, análisis de expresión génica diferencial, análisis de enriquecimiento funcional, análisis de redes de interacción de proteínas, análisis metagenómico, integración de datos multi-ómicos, desarrollo de pipelines bioinformáticos, entre otros.

La unidad cuenta con equipamiento informático de alto rendimiento y acceso a bases de datos y softwares especializados. Además, participa en la formación de talentos humanos, dictando cursos de grado y posgrado sobre bioinformática aplicada a la investigación biomédica.

En síntesis, la Unidad de Bioinformática Traslacional aporta herramientas computacionales claves para acelerar el descubrimiento de nuevos conocimientos y su aplicación en medicina traslacional, colaborando así con la misión del CIMETSA.

  1. Bravo-Miana, R. del C., Soler, M. F., Ceschin, D. G., Royo, F., Negretti-Borga, D. M., Azkargorta, M., Elortza, F., Montesinos, M. del M., Pellizas, C. G., Falcón-Pérez, J. M., & Donadio, A. C. (2022). Extracellular vesicles from thyroid cancer harbor a functional machinery involved in extracellular matrix remodeling. European Journal of Cell Biology, 101(3), 151254. https://doi.org/10.1016/j.ejcb.2022.151254
  2. Pires, N. S., Lascano, C. I., Ousset, J., Ceschin, D. G., & Venturino, A. (2022). Hypothesis-driven dragging of transcriptomic data to analyze proven targeted pathways in Rhinella arenarum larvae exposed to organophosphorus pesticides. Scientific Reports, 12(1), Article 1. https://doi.org/10.1038/s41598-022-21748-6
  3. Rodriguez C, Araujo Furlan CL, Tosello Boari J, Bossio SN, Boccardo S, Fozzatti L, Canale FP, Beccaria CG, Nuñez NG, Ceschin DG, Piaggio E, Gruppi A, Montes CL, Acosta Rodríguez EV. Interleukin-17 signaling influences CD8+ T cell immunity and tumor progression according to the IL-17 receptor subunit expression pattern in cancer cells. Oncoimmunology. 2023 Oct 5;12(1):2261326. doi: 10.1080/2162402X.2023.2261326.
  4. Murga-Garrido, S. M., Hong, Q., Cross, T.-W. L., Hutchison, E. R., Han, J., Thomas, S. P., Vivas, E. I., Denu, J., Ceschin, D. G., Tang, Z.-Z., & Rey, F. E. (2021). Gut microbiome variation modulates the effects of dietary fiber on host metabolism. Microbiome, 9(1), 117. https://doi.org/10.1186/s40168-021-01061-6
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Integrantes
Dr. Danilo Ceschin

Dr. Danilo Ceschin

Investigador Adjunto CONICET

Mg. Bioq. Marina Fernández

Mg. Bioq. Marina Fernández

Becaria Doctoral

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